铁路工程是中铁上海工程局市政工程有限公司的传统业务。公司先后参与建设了皖赣、阜淮、商阜、大沙、淮南复线、宣杭、合九、京九、宁启、胶新、朔黄、神朔、株六、渝怀、宜万、新长、邯济、武九等40余条铁路和徐州、阜阳、合肥、芜湖等10余个大型铁路枢纽。近年来，中铁上海工程局市政工程有限公司积极投入了国家铁路网提速改造建设，参加了合武铁路客运专线和阜阳站改工程建设，广泛参与西煤东运铁路及铁路专线建设，先后参与了包神铁路、南钢集团新铁厂铁路线、甘泉铁路、巴准铁路、中煤场内铁路等多条运煤及企业专线施工。